Widok

Metadane zasobu

Tytuł	Identyfikacja fenotypowa oraz genotypowa bakterii z rodziny Pasteurellaceae izolowanych od psów i kotów
Osoby	Autorzy: Jarosław Król Współtwórcy: Wojciech Zawadzki (Redaktor) Partner: Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
Opis	Bakterie należące do rodziny Pasteurellaceae są małymi Gram-ujemnymi pałeczkami lub ziarniakopałeczkami, zasiedlającymi błony śluzowe, zwłaszcza układu oddechowego i rozrodczego, wielu gatunków zwierząt. Niektóre gatunki z tej grupy są znanymi patogenami pierwotnymi lub oportunistycznymi dla swoich gospodarzy, powodując znaczne straty ekonomiczne, szczególnie w hodowli bydła i drobiu. Przedstawiciele rodziny Pasteurellaceae występują także często u psów i kotów, wywołując różnorodne stany patologiczne u tych zwierząt. Ponadto, bakterie te mają dość duże znaczenie epidemiologiczne, gdyż mogą powodować infekcje u ludzi, zwłaszcza w wyniku zakażeń ran kąsanych lub transmisji drogą aerogenną. Dlatego też szybka i dokładna identyfikacja omawianych drobnoustrojów jest istotna zarówno z punktu widzenia bakteriologii weterynaryjnej, jak i medycznej. Tradycyjna identyfikacja fenotypowa bakterii z rodziny Pasteurellaceae sprawia wciąż wiele trudności. Korzystną alternatywą są metody identyfikacji oparte na badaniach DNA bakterii, a zwłaszcza analiza sekwencyjna genu 16S rRNA lub genu sodA. Sekwencjonowanie DNA jest jednak techniką zbyt kosztowną i kłopotliwą w przypadku diagnostyki rutynowej. Bardziej przydatna do tego celu mogłaby być reakcja łańcuchowej polimerazy, lecz istniejące do tej pory metody PCR przeznaczone są głównie do wykrywania lub identyfikacji szczepów Pasteurella multocida występujących u zwierząt gospodarskich. Biorąc pod uwagę aspekt ekonomiczny diagnostyki bakteriologicznej oraz fakt, że jak dotąd nie ma kompleksowego systemu identyfikacji pałeczek z rodziny Pasteurellaceae u psów i kotów, opierając się na metodzie PCR, głównym celem podjętych badań było opracowanie testów PCR pozwalających na precyzyjne rozpoznawanie bakterii należących do poszczególnych gatunków omawianej rodziny. Ponadto, w przedstawionej pracy zbadano właściwości fenotypowe drobnoustrojów należących do Pasteurellaceae izolowanych od zwierząt towarzyszących, a także zaproponowano nową procedurę diagnostyczną, będącą kombinacją metod fenotypowych oraz genotypowych, umożliwiającą identyfikację omawianej grupy bakterii w trakcie rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej. Do badań wykorzystano 150 terenowych izolatów Pasteurellaceae izolowanych od 72 kotów, 64 psów, 2 lwów i 1 tygrysa. Wśród tych szczepów 83 było wyizolowanych z błony śluzowej jamy ustnej lub gardła zwierząt zdrowych, natomiast pozostałe 67 izolatów wyosobniono z materiału klinicznego (głównie z przypadków zapalenia jamy nosowej, jamy ustnej oraz gardła). Do hodowli drobnoustrojów użyto podłoża tryptozowo sojowego z dodatkiem 5% krwi baraniej. Badane szczepy identyfikowane były za pomocą metod fenotypowych oraz analizy sekwencyjnej genu 16S rRNA. Startery do gatunkowo-swoistych reakcji PCR zaprojektowane poprzez porównanie dostępnych w GenBanku sekwencji genów: sodA w przypadku Pasteurella canis, P. dagmatis, P. stomatis i P. pneumotropica oraz kmt dla P. multocida. Z kolei startery specyficzne dla Haemophilus haemoglobinophilus oraz Bisgaard Taxon 16, oskrzydlające fragmenty genu 16S rRNA, zostały opracowane na podstawie zarówno sekwencji dostępnych w GenBanku, jak i uzyskanych z izolatów własnych. Zastosowane metody fenotypowe oraz porównanie sekwencji genu 16S rRNA za pomocą programu BLAST pozwoliły na identyfikację, odpowiednio, 73,3 i 83,5% analizowanych szczepów. Znacznie skuteczniejsza okazała się nowo opracowana metoda diagnostyczna, stanowiąca połączenie wstępnej identyfikacji fenotypowej i techniki PCR z wykorzystaniem starterów gatunkowo-swoistych, gdyż umożliwiła rozpoznanie wszystkich badanych izolatów. Spośród 150 szczepów Pasteurellaceae poddanych identyfikacji 68 (45,3%) należało do gatunku P. multocida (w tym 39 zaliczono do podgatunku P. multocida subsp. multocida oraz 29 do P. multocida subsp. septica), 34 (22,7%) do Bisgaard Taxon 16, 19 (12,7%) do P. canis, 16 (10,7%) do P. dagmatis, 7 (4,7%) do H. haemoglobinophilus oraz 6 (4%) do P. stomatis. Dodatkowo, w niniejszej pracy przedstawiono nową metodę identyfikacji obu stwierdzonych podgatunków P. multocida opierając się na analizie polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (PCR-RFLP). Stwierdzono, że stosowane dotychczas metody fenotypowe (badanie rozkładu sorbitolu oraz próba na α-glukozydazę) nie są skutecznym sposobem różnicowania tych podgatunków. Przeprowadzona analiza sekwencyjna genu 16S rRNA u szczepów P. dagmatis izolowanych od kotów wykazała, że różnią się one dość istotnie (stopień podobieństwa wynosił 97%) od szczepów tego gatunku pochodzących od psów. Wykonane dodatkowo badania filogenetyczne porównujące sekwencje nukleotydów genu rpoB potwierdziły, że P. dagmatis jest gatunkiem genetycznie niejednorodnym. Obejmuje on dwie linie ewolucyjne, o randze co najmniej podgatunku, z których jedna występuje u psów, a druga u kotów. Obie te subpopulacje mogą być rozróżniane wyłącznie za pomocą metod genotypowych, a opracowana w tym celu technika PCR-RFLP może znaleźć praktyczne zastosowanie w badaniach epidemiologicznych, w przypadku zakażeń u człowieka powodowanych przez P. dagmatis. (Polski) Uwagi: Monografia zawiera streszczenie w j. angielskim. Seria: Współczesne Problemy Medycyny Weterynaryjnej 7. Książki i czasopisma Uniwersytetu Przyrodniczego
Słowa kluczowe	"Reakcja łańcuchowa polimerazy"@pl, "Koty"@pl, "diagnostyka bakteriologiczna"@pl, "Pasteurellaceae"@pl, "16s rRNA"@pl, "rpoB"@pl, "psy"@pl
Klasyfikacja	Typ zasobu: książka Dyscyplina naukowa: dziedzina nauk weterynaryjnych (2011) Grupa docelowa: ogół społeczeństwa Szkodliwe treści: Nie
Charakterystyka	Miejsce wydania: Wrocław Wydawca: Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu Czas wydania: 2012 Liczba stron: 80 Nazwa serii: Monografie Numeracja: CLI ISBN: 978-83-7717-108-0 Język zasobu: Polski Identyfikatory: OAI: 19283
Linki zewnętrzne	Dolnośląska Biblioteka Cyfrowa
Licencja	CC BY-ND-NC 4.0
Informacje techniczne	Deponujący: Magdalena Kozińska Data udostępnienia: 29-11-2018
Kolekcje	Kolekcja Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu

Cytowanie

Skopiowano

Jarosław Król. Identyfikacja fenotypowa oraz genotypowa bakterii z rodziny Pasteurellaceae izolowanych od psów i kotów. [książka] Dostępny w Atlasie Zasobów Otwartej Nauki, . Licencja: CC BY-ND-NC 4.0, https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/legalcode.pl. Data dostępu: DD.MM.RRRR.

Podobne zasoby

Naczyniak 2

Marcin Nowak, preparat histopatologiczny - zwierzę, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, dziedzina nauk weterynaryjnych (2011)

Puli

Jerzy Monkiewicz, Jolanta Wajdzik, Katarzyna Rogowska, inny dokument, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, dziedzina nauk rolniczych / zootechnika (2011)

Ocena funkcjonowania tarczycy przez pomiar stężenia tyroksyny, specyficznej tyreotropiny oraz przeciwciał antytyreoglobulinowych w surowicy psów w stanie eutyreozy i hipotyreozy

Jarosław Popiel, książka, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, dziedzina nauk weterynaryjnych (2011)

Identyfikacja fenotypowa oraz genotypowa bakterii z rodziny Pasteurellaceae izolowanych od psów i kotów

Metadane zasobu

Cytowanie

Podobne zasoby

Naczyniak 2

Puli

Ocena funkcjonowania tarczycy przez pomiar stężenia tyroksyny, specyficznej tyreotropiny oraz przeciwciał antytyreoglobulinowych w surowicy psów w stanie eutyreozy i hipotyreozy

Rak prostaty - biopsja 4

Naczyniak 3

figury podziałów mitotycznych 1